الفهرس 
IntroductionOnly 14 pages are availabe for public view
 |  | from | 123 |  |  |
| | | from | 123 | | |
Abstract
تمهيد:يعتبر فيروس الالتهاب الكبدى الوبائي سي مشكله كبيره على الصعيد العالمي حيث يعاني ما يقرب من 71 مليون شخص من الالتهاب الكبدي سي المزمن؛ ولقد اوضحت بعض الدراسات ان معظم الاصابه في مصر بفيروس الالتهاب الكبدى الوبائس سي من خلال النمط الجيني 4 وخاصه 4أ الذي اصبح منتشر ومتوطن. ان أشباه الأنواع (َQuasispecies) او المغايرات النادرة تعتبر طقرات نادرة التى بدروها تمثل مشكله كبيره تجاه مقاومه الادويه والجهاز المناعى . حيث أوضحت بعض الدراسات انه باستخدام تقنيه الجيل القادم لترتيب القواعد النيتروجينية نستطيع أن نفهم ديناميكيه المتغايرات لفيروس الكبد الوبائي سي من خلال سهوله التعرف علي هذه المتغايرات . الهدف:الهدف الرئيسي من العمل هو اكتشاف الاختلافات النادرة بفيروس الالتهاب الكبدى الوبائي سي باستخدام تقنيه الجيل القادم لترتيب القواعد النيتروجينية. الخطوات العملية:تم عزل الحمض النووي الريبوزي الفيروسي من البلازما باستخدام مجموعة استخلاص الحمض النووي الريبوزي الفيروسية وفقا لإرشادات الشركة المصنعة. تم إعداد مكتبات عينات من الجينوم الفيروسي باستخدام مجموعة إعداد عينات (TruSeq) الإصدار 2 (Illumina) سان دييغو، كاليفورنيا، الولايات المتحدة الأمريكية؛ وأجريت الخطوات التالية من تجزئة الحمض النووي الريبوزي، وتصنيع وفهرسة الحمض النووي الريبوزي المنقوص الأكسجين التكميلي (cDNA)، وتضاعف وتنظيف تفاعل إنزيم البلمرة المتسلسل (PCR)، وتطبيع وتجميع المكتبة وفقاً لإرشادات الشركة المصنعة. تم إجراء عملية التسلسل باستخدام جهاز تسلسل (MiSeq) مع مجموعة كاشف (MiSeq) الإصدار 2 (300 دورة؛ Illumina).النتائج:كان من البيانات التي وصلنا إليها؛ أن الفيروس الكبدي سي من النمط الجيني 4أ (HCV G-4a) هو النمط الأكثر انتشارًا بين العينات وتم اكتشاف العدوى المصاحبة لفيروس الالتهاب الكبدي جي (HPgV) في مريض واحد من المجموعة الساذجة. وايضا لقد نجحنا في رصد تعدد أشكال النيوكليوتيدات المفردة (SNP) المختلف النادر على طول الجينوم؛ والذي يؤدي إلى تكوين مغايرات مختلفة في كل عينة من كلتي المجموعتين.الاستنتاج:في هذه الدراسة ، نجحنا تقريباً في رصد وتحديد تسلسل الجينوم الكامل الكلي لفيروس الالتهاب الكبدي سي؛ وكذلك التنوع الجيني (الاختلافات النادرة) مباشرة من بلازما كلتي المجموعتين (الساذجة والمنتكسة) من المرضى باستخدام تسلسل Illumina العميق وبدون استخدام أي بادئات محددة (Specific primers).